1. Nhà tù Green Dolphin Street năm 2011 và Jolyne Cujoh
Nhân vật chính: Jolyne Cujoh – con gái ruột của Jotaro Kujo. Cô bị gài bẫy vào tù chịu án 15 năm vì tội ác mà bạn trai cô gây ra. Ban đầu là một thiếu nữ có phần nổi loạn và cảm thấy bị bỏ rơi bởi người cha bận rộn, Jolyne dần trưởng thành thành một nữ anh hùng kiên cường, bản lĩnh đúng chất dòng máu Joestar.
Sức mạnh Stone Free: Stand của Jolyne cho phép biến cơ thể cô thành những sợi dây bền chắc. Dù thoạt nghe có vẻ đơn giản, Jolyne lại sáng tạo ra vô số cách sử dụng cực kỳ thông minh: từ việc truyền tin, khâu vết thương, tạo màng lọc cho đến chiến đấu tầm xa. Câu cửa miệng huyền thoại của cô là "Yare Yare Dawa" (Trời ạ).
2. Biệt đội nhà tù "Stone Ocean"
Đồng hành cùng Jolyne trong chốn ngục tù khắc nghiệt là những người bạn tù có hoàn cảnh đặc biệt:
Ermes Costello: Người phụ nữ trượng nghĩa, mạnh mẽ, sở hữu Stand Kiss có khả năng tạo ra các sticker dán lên vật thể để nhân bản chúng, sau đó khi bóc sticker ra thì các bản sao sẽ dính chặt lại và tự hủy diệt gây sát thương lớn.
Emporio Alnino: Cậu bé sinh ra và lớn lên trong nhà tù, sở hữu Stand Burning Down the House tạo ra một "căn phòng ma" an toàn ẩn giấu bên trong kiến trúc nhà tù.
Weather Report: Anh chàng mất trí nhớ có vẻ ngoài lạnh lùng nhưng vô cùng trầm ổn, sở hữu Stand điều khiển thời tiết cực kỳ bá đạo (Weather Report) có thể tạo ra sấm sét, mây độc, ếch mưa, thậm chí biến đối thủ thành sên.
Narciso Anasui: Kẻ sát nhân si tình, điên cuồng bám theo Jolyne, sở hữu Stand Diver Down có khả năng chui vào bên trong cơ thể người hoặc vật thể để định hình lại cấu trúc, tấn công nội tạng hoặc hấp thụ sát thương.
3. Ác nhân thiên tài: Cha xứ Enrico Pucci và Âm mưu "Thiên đường"
Kẻ chủ mưu ẩn mặt: Kẻ thù chính của phần này không phải là một tên trùm bạo lực, mà là Enrico Pucci – một linh mục tận tụy trong nhà tù, nhưng thực chất lại là người bạn tâm giao, tôn sùng tư tưởng của... DIO (từ Phần 3).
Trí tuệ và tiến hóa Stand: Whitesnake – Stand của Pucci có khả năng rút ký ức và Stand của con người ra thành dạng "đĩa" (Disk) để thao túng hoặc trao cho kẻ khác.
Mục tiêu đạt đến "Thiên đường": Pucci thực hiện kế hoạch của DIO nhằm đạt được trạng thái "Thiên đường" (Heaven), giúp nhân loại biết trước tương lai và chấp nhận số phận của chính mình. Để làm được điều này, Whitesnake lần lượt tiến hóa qua các hình thái kinh hoàng: C-Moon (điều khiển trọng lực) và đỉnh cao là Made in Heaven.
4. Cuộc chiến tận thế và Sự hy sinh của các thế hệ
Jotaro xuất hiện: Khi Jolyne gặp nguy hiểm, Jotaro Kujo đã đột nhập vào nhà tù để giải cứu con gái. Tuy nhiên, vì bảo vệ Jolyne, Jotaro đã bị Pucci trúng kế, cướp đi cả đĩa ký ức lẫn đĩa Stand, rơi vào trạng thái hôn mê sâu. Jolyne phải chiến đấu kiên cường để giành lại sự sống cho cha mình.
Bi kịch chặng cuối: Khi Pucci sở hữu Made in Heaven – Stand có khả năng tăng tốc thời gian đến vô cực, mọi quy luật vật lý bị đảo lộn. Thời gian trôi nhanh khủng khiếp, vạn vật chuyển dời chớp nhoáng. Để bảo vệ Emporio (người sống sót duy nhất), lần lượt Jolyne, Weather Report, Anasui và Ermes đã chiến đấu đến hơi thở cuối cùng và hy sinh anh dũng.
5. Sự tái sinh của vũ trụ (The Universe Reset)
Vũ trụ mới và Irene: Khi Made in Heaven hoàn thành một vòng quay thời gian, vũ trụ cũ sụp đổ và một vũ trụ hoàn toàn mới được hình thành, nơi mọi sinh linh đều được chuyển sang phiên bản số phận mới của họ (trừ Pucci bị cậu bé Emporio dùng mưu trí kết liễu trước khi thế giới ổn định).
Kết cục đầy hy vọng: Tại vũ trụ mới (thường được gọi là Ireneverse), chúng ta thấy những phiên bản an yên, hạnh phúc của Jolyne – nay tên là Irene, không còn phải chịu những lời nguyền hay tai ương của gia tộc Joestar nữa, cùng với Anasui (nay là phiên bản hiền lành hơn) và những người bạn cũ khởi đầu một cuộc đời mới trong ánh bình minh rạng rỡ.
